1994 yılında Tabiatı Koruma Alanı ilan edilen Bafa Gölü, buna rağmen yıllar içinde ciddi çevresel sorunlarla karşı karşıya kaldı. Gölü besleyen suların azalması, kimyasal dengenin bozulması ve oksijen seviyesinin düşmesi yüz binlerce balığın ölümüne neden oldu. Büyük Menderes Nehri ile göl arasındaki bağlantının kopması ve çevredeki tesislerden gelen atıkların göle karışması, ekosistemi geri dönülmesi zor bir noktaya sürükledi.
Son yağışlar ve nehirden sağlanan suyla birlikte gölde yaşanan seviye artışı, uzun süredir olumsuz tabloyla anılan Bafa Gölü için yeni bir umut oluşturdu. Gözle görülür bu değişim, hem doğal yaşamın toparlanması hem de ekosistemin yeniden dengeye kavuşması açısından dikkatle izleniyor. Gölün suyla yeniden buluşması, Bafa Gölü’nün kaderinde yeni bir sayfanın açılıp açılmayacağı sorusunu da beraberinde getiriyor.