Akdeniz Üniversitesi Hastanesinde bir süredir kanser tedavisi gören Karpuzoğlu, 82 yaşında öldü. Ülkemizde ilk organ ve doku nakli uygulamalarının öncülerinden olan Prof. Dr. Tuncer Karpuzoğlu, 31 Kasım 1991'de Akdeniz Üniversitesindeki Organ Nakli bölümünün de kurucusu olmuş ve ilk organ naklini yapmıştı.

Akdeniz Üniversitesinde halen Prof. Dr. Tuncer Karpuzoğlu'nun ismini taşıyan Organ Nakli Enstitüsü hizmet veriyor.

Karpuzoğlu'nun vefat haberi tıp camiasını yasa boğdu