Tasarı, gümrük vergilerinin de yeniden yapılandırılmasını öngörüyor. Bu düzenlemeye göre, gümrük idaresi tarafından takip ve tahsil edilen vergiler yapılandırma konusu olacak. Gümrük ve Ticaret Bakanlığı'nın az önce açıkladığı verilere göre, 2.6 milyar TL vergi alacağı bulunuyor. Bu alacaklara ilişkin ceza kararı ise toplamda 8.8 milyar TL. Tasarı yasalaşınca toplamda ise 11.5 milyar TL gümrük alacağı yapılandırılacak.